我们很高兴地宣布激光基因18现在可以下载了。
此版本带来了重要的新特性和改进的功能，包括对GenVision Pro的重大更新，我们的应用程序用于可视化和分析多个样本的基因组数据。Lasergene 18中的新功能包括：
- 分阶段变异分析
- 跨样本的变体比较
- 基因集富集分析（GSEA）
- 在自定义本地数据库中搜索序列
- 金门克隆
- 用IQ树构建的系统发育树
我们当前的安装程序还包含对影响SeqBuilder Pro的以下已知问题的修复：
- 当计算机的语言是非英语时，SeqBuilder Pro会给出“基本字符串”错误
- 当计算机的语言是非英语时，SeqBuilder Pro给出“无效字符串位置”错误
- SeqBuilder Pro的圆形视图部分覆盖了macOS 15上的相邻视图
分阶段变异分析
激光基因基因组学现在包括一种二倍体分阶段算法，用于分析与完整人类基因组一样大的长时间读取的数据集。
- 只需选择一个新的变体检测选项，即可在SeqMan NGen中开始分阶段单倍型工作流程。
- 在GenVision Pro的新基因组视图中查看整个基因组的阶段/非阶段区域。
- 使用GenVision Pro中的几个新轨道和选项，可视化和分析分阶段对齐读取、分阶段块、分阶段一致性和分阶段变体。
- 导出阶段共识块以获得感兴趣基因的母体和父体单倍体序列。
跨多个实验的变体比较
GenVision Pro现在提供了全面比较变体来自多个实验的能力。
- 将SeqMan NGen程序集、BAM和/或VCF文件导入GenVision Pro。
- 基于维恩图、单个或多个基线对照、配对样本（例如，正常与肿瘤）、包含变体的样本或对的最小百分比以及许多其他选项过滤变体。保存过滤器或将其设置为未来项目的默认过滤器。
- 查看在SeqMan NGen中组装的人类样本的变体注释数据库信息。
- 创建变量集，并将其与维恩图、并集、交集或包含每个变量的最小百分比集进行比较。
- 将变体和变体集导出为CSV或制表符分隔的文本文件。
基因集富集分析（GSEA）
GSEA是RNA-Seq差异表达工作流程的专门版本，专注于具有一些共同点的基因组，如调节、染色体位置或生物功能。
- 当满足DESEQ2或EdgeR分析的标准时，访问SeqMan NGen中的GSEA计算方法。
- 了解一组预定义的基因是否显示两种生物状态（例如，表型）之间的统计显著差异。
- 选择31人、19小鼠、秀丽隐杆线虫和酵母分析选项中的任何一个。
- 在专门的气泡图中查看输出，该气泡图列出了来自所选分析集的差异表达的基因，并在显示上调和下调基因集的聚类图中查看输出。
自定义本地数据库中的搜索序列
GenVision Pro、Protean 3D、SeqMan Ultra和MegAlign Pro现在都提供了为本地BLAST搜索创建安全本地序列数据库的能力。
- 上传本地文件或从NCBI导入序列，有30多个数据库可供选择。
- 使用本地数据库管理器合并、展开、重命名和/或删除本地数据库。
- 本地搜索比在线搜索快5-25倍。
金门克隆
SeqBuilder Pro现在支持金门虚拟克隆，精确和无疤痕的克隆。
- 使用一个简单的向导设置克隆，该向导可以检测可能的故障并提供有用的反馈。
- 查看克隆的所有组件的功能。
- 轻松去除不需要的限制位点（驯化）。
使用IQ Tree
MegAlignPro构建的系统发育树现在包含了构建系统发育树的IQ Tree算法，这种广泛使用的最大似然方法快速、准确，支持无融资创业。
- 从4种可用的系统发育计算方法中选择IQ树。
- 生成和比较由不同方法创建的多个树。
- 自定义和导出您的系统发育树以供发布或协作。